「譲渡所得の内訳書（土地・建物用）」＞「3面」タブ＞「4　譲渡所得金額の計算をします。」の「A 収入金額」・「B 必要経費」・「E 譲渡所得金額」に金額がありますが、第三表に連動されない。

「4　譲渡所得金額の計算をします。」の一番左にある「区分」の項目リストから、「短期（一般分）」・「短期（軽減分）」・「長期（一般分）」・「長期（特定分）」・「長期（軽課分）」のいずれかを選択してください。
第三表の「収入金額」・「所得金額」に連動されます。
なお、第三表の「分離課税の短期・長期譲渡所得に関する事項」の各項目については手入力をお願いします。